Учреждена приказом ФСБ России в июне 2006 года.

Медаль "За заслуги в обеспечении информационной безопасности" ФСБ РФ имеет порядковый номер, располагается перед медалью "За отличие в специальной операции".

Медаль из латуни, имеет диаметр 32 мм. На лицевой стороне медали изображен щит с рельефным изображением двуглавого орла и расположенный за ним меч. Поле щита покрыто темно-красной силикатной эмалью. Щит с мечом обрамляют лавровые ветви с особым образом вплетенной лентой. Поле вокруг щита с мечом, ленты и ветвей лавра покрыто васильковой (черной) силикатной эмалью.

Лента покрыта васильковой (синей) силикатной эмалью. На ленте слева, внизу и справа от щита с мечом надпись: «За заслуги в обеспечении информационной безопасности».
На оборотной стороне медали надпись: "Федеральная служба безопасности Российской Федерации", под которой указывается порядковый номер медали. Снизу по бокам медали вдоль ее краев изображение лавровых ветвей. Все изображения и надписи на медали выпуклые.